Xrcc1 arg399gln ja arg194trp polümorfismid eesnäärmevähi riskis: metaanalüüs | eesnäärmevähk ja eesnäärmehaigused

Xrcc1 arg399gln ja arg194trp polümorfismid eesnäärmevähi riskis: metaanalüüs | eesnäärmevähk ja eesnäärmehaigused

Anonim

Õppeained

  • Epidemioloogia
  • Geneetiline variatsioon
  • Eesnäärmevähk

Abstraktne

Epidemioloogiliste uuringutega hinnati röntgenkiirguse remondiga ristkomplementeeruva 1. rühma geeni (XRCC1) Arg399Gln ja Arg194Trp polümorfismide seost ja eesnäärmevähi riski (PCa). Nende kahe XRCC1 polümorfismi ja PCa riski vahelise seose avaldatud uuringute tulemused on siiski vastuolulised. XRCC1 polümorfismide ja PCa riski vahelise seose täpsema hinnangu saamiseks viisime läbi meta-analüüsi. Kõigi XRCC1 polümorfismide ja PCa riski juhtumikontrolli uuringute tuvastamiseks viidi läbi ulatuslik otsing. Seose tugevuse hindamiseks kasutasime koefitsientide suhteid (OR) 95% usaldusvahemikuga (CI). Üldiselt leidsime, et nii Arg399Gln kui ka Arg194Trp polümorfismid ei olnud PCa riskiga märkimisväärselt seotud. Etnilisuse järgi kihistunud analüüsis leidsime, et Arg399Gln polümorfism oli aga Aasia elanikkonnas märkimisväärselt seotud PCa riskiga (Gln / Gln vs Arg / Arg: OR = 1, 46, 95% CI: 1, 05–2, 03, P = 0, 03; Gln / Gln vs Arg / Gln + Arg / Arg: VÕI = 1, 48, 95% CI: 1, 12–1, 95, P = 0, 01). Selles metaanalüüsis avastasime, et nii Arg399Gln kui Arg194Trp polümorfismid ei olnud seotud üldise PCa riskiga. Alarühmanalüüsis leidsime siiski soovituse, et XRCC1 399Gln alleel võib olla ainult Aasia meestel PCA riskitegur.

Sissejuhatus

Eesnäärmevähk (PCa) on lääneriikides meeste seas kõige tavalisem pahaloomuline kasvaja. 1 PCa etioloogia on halvasti mõistetav ning tõenäoliselt aitavad riski kaasa geneetiline eelsoodumus ja keskkonnategurid. 2 PCA riskiga seotud kõige tuntumad tegurid on haiguse rahvus, vanus ja perekonna ajalugu. Lisaks on uuringud teatanud, et nii endogeensed / eksogeensed hormonaalsed ained kui ka mõned geenipolümorfismid võivad olla PCa potentsiaalsed riskifaktorid. 3, 4, 5 Värsked uuringud viitavad sellele, et DNA parandamises osalevate geenide, sealhulgas röntgenkiirguse parandamise ristkomplementeeruva 1. rühma geeni (XRCC1) geneetilised polümorfismid võivad mõjutada vastuvõtlikkust PCa suhtes. 6, 7, 8

XRCC1 geen, mis asub kromosoomis 19q13.2–13.3, osaleb DNA aluse kahjustuste ja ühe ahelaga DNA purunemiste parandamises, sidudes DNA ligaasi III selle karboksüülrühma ning DNA polümeraasi ja polü (adenosiindifosfaadi riboos) polümeraasi kahjustatud DNA koht. 9 XRCC1 kustutamine hiirtel annab embrüonaalse letaalse fenotüübi. 10 Hiina hamstri munasarja rakuliini, millel on mutatsioonid XRCC1-s, on näidanud vähenenud võimet parandada DNA ühe ahela purunemisi ja samaaegset raku ülitundlikkust ioniseeriva kiirguse ja alküülivate ainete suhtes. 11

XRCC1 omab olulist rolli endogeense ja eksogeense DNA kahjustuste eemaldamisel. Arg399Gln (ekson 10, alus 28152 G kuni A, arginiin glutamiiniks) ja Arg194Trp (ekson 6, alus 26304 C kuni T, arginiin trüptofaanini) on XRCC1 kaks levinumat polümorfismi. Need kaks polümorfismi, mis hõlmavad aminohapete muutust evolutsiooniliselt konserveerunud piirkondades, võivad muuta XRCC1 funktsiooni. XRCC1 Arg399Gln variant asub polü (adenosiindifosfaat riboos) polümeraasiga interakteeruva domeeni COOH-otsas küljes suhteliselt mittekonserveerunud piirkonnas BRCT konserveerunud jääkide vahel (esimest korda kirjeldati rinnavähi valgu karboksüülotsas) vähk 1) domeen, mis on näidustatud valkude ja valkude interaktsiooni moodulina paljudes DNA remondiga seotud valkudes. 12 Lisaks võib variant olla seotud mitme fenotüüpse muutusega, sealhulgas õdede kromatiidivahetuse kõrgema taseme, 13 aflatoksiin B1 – DNA aduktide, glükophoriini A mutatsioonide 14 ja polüfenool-DNA aduktidega. 15 Arg194Trp polümorfismi, mis toimub prolifereeruva raku tuuma antigeeni siduvas piirkonnas, soovitatakse parandada DNA individuaalset paranemisvõimet. 16 Seni on paljud uuringud keskendunud seostele PCa riski ja DNA remonditee geenide polümorfismide vahel. Nende uuringute 6, 7, 8, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 tulemused on siiski vastuolulised ja ebaselged. Seetõttu on äärmiselt vajalik läbi viia kvantitatiivne ja süsteemne uuring rangete meetoditega. Käesolevas uuringus viidi läbi kõigi kõlblike uuringute metaanalüüs, et uurida seost XRCC1 polümorfismide (Arg399Gln ja Arg194Trp) ja PCa riski vahel.

materjalid ja meetodid

Väljaannete otsing

Otsiti PubMed ja EMBASE (viimast otsingut värskendati 2011. aasta märtsis), kasutades otsingutermineid: 'XRCC1 või röntgenikiirguse parandamise ristkomplementeeriv rühm 1', 'polümorfism' ja 'eesnäärmevähk või eesnäärme kasvaja'. Välja toodi kõik ingliskeelsed avaldatud artiklid koos kõlblikele kriteeriumidele vastava täistekstiga. Lisaks kontrollisime ka meie otsingu käigus saadud asjakohaste arvustuste ja sobilike artiklite viiteid. Kaks uurijat otsisid kirjandust ja hankisid andmeid sõltumatult.

Kaasamine, välistamise kriteeriumid ja andmete võtmine

Sellesse metaanalüüsi lisamiseks pidid tuvastatud artiklid sisaldama teavet järgmise kohta: (1) XRCC1 Arg399Gln ja / või Arg194Trp polümorfismide ja PCa riski hindamine, (2) kasutades juhtumikontrolli kavandit ja (3) piisavad andmed koefitsientide suhte (OR) uurimiseks 95% usaldusvahemikuga (CI); (4) kattuvate patsientide uuringute ja kontrollide kohta tuleks lisada uusim ja / või suurim ekstraheeritavate andmetega uuring. Uuringute väljajätmise peamised põhjused olid järgmised: (1) kontrolljuhtumeid ei olnud; 2) kasutatavaid andmeid pole esitatud; (3) duplikaadid. Iga abikõlbliku juhtumikontrolli uuringu kohta koguti järgmised andmed: esimene autor, avaldamisaasta, katsealuste etniline kuuluvus, kontrollide allikas, genotüübiga seotud juhtumite ja kontrollide arv, genotüüpimismeetodid. Erinevad etnilised päritolud liigitati Kaukaasia, Aasia ja Aafrika rühmadesse. Uuringute 21, 23, sealhulgas erinevate etniliste populatsioonide kohta, koguti andmed võimaluse korral eraldi ja neid kasutati iseseisvate uuringutena. Kuna ühes uuringus 25 esitati genotüüpide andmed kujul "Arg / Arg, Arg / Gln + Gln / Gln" ilma kõigi kolme genotüübi andmeteta, saame OR-i arvutada ainult domineeriva mudeli jaoks.

Statistiline analüüs

XRCC1 Arg399Gln ja Arg194Trp polümorfismide ja PCa riski vahelise seose tugevust mõõdeti OR-de abil 95% CI-ga. XRCC1 Arg399Gln polümorfismi korral uurisime esmalt PCa-l variantide genotüüpide Gln / Gln või Gln / Arg riski võrreldes metsiktüüpi Arg / Arg homosügootiga. Seejärel hinnati (Gln / Gln + Gln / Arg) vs Arg / Arg ja Gln / Gln vs (Gln / Arg + Arg / Arg) PCa riski valdavates ja retsessiivsetes mudelites. XRCC1 Arg194Trp polümorfismi korral hindasime samu mõjusid. Stratifitseeritud ja meta-regressioonanalüüsid viidi läbi etniliste rühmade kaupa.

Heterogeensuse eeldust kontrolliti χ 2- põhise Q- testi abil. 26 Q- testi P- väärtus üle 0, 05 näitas uuringute heterogeensuse puudumist, seega arvutati iga uuringu kokkuvõtlik VÕI hinnang fikseeritud efektide mudeli abil (Mantel – Haenszeli meetod). Muul juhul kasutati juhuslike efektide mudelit (DerSimoniani ja Lairdi meetod). 27, 28 Ühendatud OR olulisus määrati Z- testiga ja P <0, 05 peeti statistiliselt oluliseks. Kovariatsiooniefektide hindamiseks viidi erinevate etniliste rühmade alusel läbi alagruppide ja meta-regressioonanalüüsid. Tehti Monte Carlo permutatsioonikatse (iteratsioonid = 20 000), et korrigeerida P- väärtust mitme võrdluse jaoks, tuginedes Higgins et al. 29 Knapi ja Hartungi seadistusi kasutati ka I tüüpi veamäära kontrollimiseks. 30

Uurimaks, kas avaldamishälbed võivad mõjutada hinnangute paikapidavust, koostati lehtri graafik. Asümmeetriline graafik viitab võimalikule avaldamise kallutatusele. Lehtri graafiku asümmeetriat hinnati Eggeri lineaarse regressioonitesti meetodiga, lineaarse regressiooniga, et mõõta lehtri graafiku asümmeetriat OR loodusliku logaritmi skaalal. Peatükkide olulisus määrati Eggeri soovitatud t- testiga ( P <0, 05 peeti statistiliselt oluliste publikatsioonihäirete esindajaks). Hardy – Weinbergi tasakaalu kontrollrühmas testiti, kasutades Pearsoni χ 2- testi sobivuse tugevuse osas; P <0, 05 peeti oluliseks.

Kõik statistilised analüüsid viidi läbi Stata tarkvaraga (versioon 9.0; StataCorp LP, College Station, TX, USA), kasutades kahepoolset P-väärtust .

Tulemused

Abikõlblikud uuringud

Kaasati neliteist uuringut, mis põhinesid XRCC1 Arg399Gln ja Arg194Trp polümorfismidega seotud PCa tundlikkuse otsingukriteeriumidel. Uuringute karakteristikud on kokkuvõtlikult esitatud tabelis 1. Seal oli viis uuringut Aasia päritolu subjektidega, seitse uuringut Kaukaasia päritolu subjektidega ja kaks uuringut Aafrika päritolu subjektidega. Nende uuringute hulgas on seitsmes uuringus uuritud ainult Arg399Gln polümorfismi, seitsmes uuringus aga Arg399Gln ja Arg194Trp polümorfisme. Seetõttu tehti Arg399Gln polümorfismi kohta 14 uuringut 3782 juhtumiga ja 3775 kontrolliga ning Arg399Gln polümorfismiga seitse uuringut 2153 juhtumiga ja 2219 kontrolliga.

Kõigis uuringutes kasutati juhtumite järgi vanuse, soo või etnilise kuuluvuse järgi sagedusega vastavaid kontrolle. Klassikalise PCR-restriktsiooni fragmendi pikkuse polümorfismi test viidi läbi üheksas uuringus. Ülejäänud viies kasutati amplifikatsioonikindla mutatsioonisüsteemi, Applied Biosystems (ABI, Foster City, CA, USA) SNPlex (ABS) genotüpiseerimissüsteemi, maatriks-abil toimivat laser-desorptsiooni ionisatsiooni aega lennumass-spektromeetrias ja homogeenset MassExtend (HM) multipleksanalüüsi. uuringud. Kõigi uuringute genotüübi jaotus kontrollide vahel järgnes Hardy – Weinbergi tasakaalule, välja arvatud üks uuring 23 Aafrika populatsioonis Arg194Trp polümorfismi kohta.

Meta-analüüs

Arg399Gln üldises analüüsis ei olnud Gln / Gln ja Arg / Gln genotüübid märkimisväärselt seotud PCa suurenenud riskiga (Gln / Gln vs Arg / Arg: OR = 1, 04, 95% CI: 0, 90–1, 22, P = 0, 58; Arg / Gln vs Arg / Arg: OR = 0, 93, 95% CI: 0, 84–1, 03, P = 0, 17; tabel 1, joonis 1). Sarnast negatiivset seost hoiti domineerivates ja retsessiivsetes mudelites (Gln / Gln + Arg / Gln vs Arg / Arg: OR = 0, 99, 95% CI: 0, 90–1, 09, P = 0, 84 ja Gln / Gln vs Arg / Gln + Arg / Arg: VÕI = 1, 11, 95% CI: 0, 96–1, 27, P = 0, 16; tabel 1). Sarnaselt ei leitud XRCC1 Arg194Trp polümorfismi märkimisväärselt seotud suurenenud PCa riskiga (kuupäev on näidatud 2. lisa tabelis, joonis 2).

Täissuuruses tabel

Image

XRCC1 Arg399Gln polümorfismiga seotud eesnäärmevähi riski metsatükk (Gln / Gln vs Arg / Arg). Ruudud ja horisontaaljooned vastavad uuringuspetsiifilisele koefitsientide suhtele (OR) ja 95% usaldusvahemikule (CI). Ruutude pindala kajastab kaalu (dispersiooni pöördväärtus). Teemant tähistab kokkuvõtet VÕI ja 95% CI.

Täissuuruses pilt

Image

XRCC1 Arg194Trp polümorfismiga seotud eesnäärmevähi riski metsatükk (Trp / Trp vs Arg / Arg). Ruudud ja horisontaaljooned vastavad uuringuspetsiifilisele koefitsientide suhtele (OR) ja 95% usaldusvahemikule (CI). Ruutude pindala kajastab kaalu (dispersiooni pöördväärtus). Teemant tähistab kokkuvõtet VÕI ja 95% CI.

Täissuuruses pilt

Arg399Gln polümorfismi etnilisuse järgi kihistunud analüüsis näitasid meie tulemused, et Gln / Gln genotüüp oli Aasia elanikkonnas märkimisväärselt seotud PCa suurenenud riskiga (Gln / Gln vs Arg / Arg: OR = 1, 46, 95% CI: 1, 05–2, 03)., P = 0, 03; tabel 1, joonis 1). Seda sarnast positiivset seost hoiti retsessiivses mudelis (Gln / Gln vs Arg / Gln + Arg / Arg: OR = 1, 48, 95% CI: 1, 12–1, 95, P = 0, 01; tabel 1, joonis 1). Arg194Trp polümorfismi kihistunud analüüsis ei leidnud me aga positiivset seost Arg194Trp polümorfismi ja PCa riski vahel (kuupäev on näidatud 2. lisa tabelis, joonis 2). Pärast P- väärtuse korrigeerimist mitmekordse testimise jaoks on alles mõned nõrgad tõendid selle kohta, et seos oli positiivne, kui vaadeldavat tingimust pidada äärmuslikuks või ekstreemsemaks (Gln / Gln vs Arg / Arg: korrigeeritud P = 0, 060; Gln / Gln vs Arg / Gln + Arg / Arg, korrigeeritud P = 0, 066). 31

Lisaks mitmekordsele testimisele oleme seose uurimiseks rakendanud ka Knapi ja Hartungi kohandamist. Tulemused kinnitavad veel järeldust, et Aasia populatsioonis on PCa riskiga seotud geneetiline muutuja Arg399Gln (Gln / Gln vs Arg / Arg: P = 0, 046; Gln / Gln vs Arg / Gln + Arg / Arg, P = 0, 040).

Heterogeensuse test

Arg399Gln polümorfismi korral arvestati iga uuringu vahel heterogeensust, kasutades Q- testi: homosügootide võrdlust (Gln / Gln vs Arg / Arg: P heterogeensus = 0, 37); heterosügootide võrdlus (Gln / Arg vs Arg / Arg: P heterogeensus = 0, 09); domineeriva mudeli võrdlus (Gln / Gln + Gln / Arg vs Arg / Arg: P heterogeensus = 0, 05); ja retsessiivne mudeli võrdlus (Gln / Gln vs Gln / Arg + Arg / Arg: P heterogeensus = 0, 34). Arg194Trp polümorfismi korral arvestati kõigi uuringute vahel heterogeensust, kasutades Q- testi: homosügootide võrdlust (Trp / Trp vs Arg / Arg: P heterogeensus = 0, 21); heterosügootide võrdlus (Gln / Arg vs Arg / Arg: P heterogeensus = 0, 01); domineeriva mudeli võrdlus (Gln / Gln + Gln / Arg vs Arg / Arg: P heterogeensus = 0, 01) ja retsessiivne mudeli võrdlus (Gln / Gln vs Gln / Arg + Arg / Arg: P heterogeensus = 0, 41).

Tundlikkuse analüüs

Tundlikkusanalüüsis uuriti iga uuringu mõju ühendatud OR-le, korrates meta-analüüsi, jättes iga uuringu ükshaaval läbi. See protseduur kinnitas meie tulemuse stabiilsust. Lisaks, kui välistada üks uuring 23 Aafrika populatsioonis Arg194Trp polümorfismi suhtes, mis ei järginud Hardy-Weinbergi tasakaalu, ei muutunud hinnanguline koondatud VÕI siiski üldse oluliselt (andmeid pole näidatud).

Väljaannete eelarvamused

Kirjanduse avaldamise kallutatuse hindamiseks viidi läbi Beggi lehtri proov ja Eggeri test. Lehtri graafikute kuju ei tuvastanud ühtegi tõendit lehtri graafiku asümmeetria kohta. Statistilised tulemused ei näidanud endiselt avaldatud eelarvamusi (Arg399Gln polümorfismi korral: P = 0, 13 Gln / Gln vs Arg / Arg, P = 0, 72 Gln / Arg vs Arg / Arg, P = 0, 75 domineeriva mudeli korral ja P = 0, 09 retsessiivse korral mudel; Arg194Trp polümorfismi korral: P = 0, 22 Trp / Trp vs Arg / Arg, P = 0, 60 Trp / Arg vs Arg / Arg, P = 0, 69 domineeriva mudeli jaoks ja P = 0, 20 retsessiivse mudeli korral).

Arutelu

Uurisime süstemaatiliselt kirjandust ja ühendasime selles meta-analüüsis saadaolevad tulemused, mis on kasulik strateegia vähktõve geneetiliste tegurite väljaselgitamiseks. 32, 33, 34 XRCC1, mis osaleb DNA parandamises, on põhjalikult uuritud seost erinevate vähiliikidega, näiteks uroteeli põievähk, 35 rinnavähk, 36 PCa 25, 37 ja nii edasi. Varasemad uuringud XRCC1 polümorfismide ja PCa riski vahelise seose kohta olid vastuolulised. Need ebajärjekindlad tulemused võivad olla tingitud polümorfismi väikesest mõjust PCa riskile või avaldatud uuringute suhteliselt madalast statistilisest võimsusest. Seetõttu oli meta-analüüs vajalik kvantitatiivse lähenemisviisi pakkumiseks erinevate uuringute tulemuste ühendamiseks sama teemaga ning nende mitmekesisuse hindamiseks ja selgitamiseks.

Käesolev metaanalüüs, sealhulgas 3782 juhtumit ja 3775 kontrolli Arg399Gln polümorfismi kohta ning 2153 juhtumit ja 2219 kontrolli Arg194Trp polümorfismi kohta, uuris XRCC1 geeni kahe potentsiaalselt funktsionaalse polümorfismi ja PCa riski seost. Üldiselt ei leidnud me, et XRCC1 Arg399Gln ja Arg194Trp polümorfismide variantide genotüübid oleksid PCa riskiga märkimisväärselt seotud. Etnilisuse järgi kihistunud analüüsis leidsime, et XRCC1 Arg399Gln polümorfismi variandi genotüüp oli PCA riskiga seotud vaid Aasia elanikkonnas.

Mitme kovariaadi põhjustatud 1. tüübi vea vähendamiseks viisime Bonferroni meetodi asemel läbi mitme testimise permutatsioonimeetodi, arvestades selle piiranguid. 38 Veel võiksime tuvastada Aasia elanikkonna vähese sissetungimise riski isegi pärast 20 000-kordse ekstreemse või ekstreemsema seisundi stimulatsiooni. 31 Seda võib tõlgendada nii, et see kirjeldab „üllatuse” astet, mis võib olla Aasia elanikkonna jaoks täheldatud tulemuse suhtes, arvestades kõigi kovariaatorite uurimist. 29

Veelgi enam, permutatsioonimeetodi tulemuseks oli mõnikord väga väikese võimsusega katsed. 39, 40 Seetõttu oleme P- väärtuse korrigeerimiseks läbi viinud ka Knapi ja Hartungi reguleerimise (mida toetavad ka Higgins jt 29 ). Knapi ja Hartungi meetod võiks tõhusalt vähendada vale-positiivsete määrasid meta-regressioonis ja reguleerida krediidiasutuste katvuse tõenäosust tegelikkusele palju lähemale. P-väärtuste ja CI arvutamisel põhineb see tavalise normaaljaotuse asemel t- jaotusel. Isegi kui Knapi ja Hartungi modifikatsioonid viivad tavaliselt konservatiivsemate P-väärtusteni , toetavad meie muudetud tulemused 41 ( P <0, 05) Aasia populatsioonis saadaolevat geneetilise variandi assotsiatsiooni. See on kooskõlas mitme katse või kihistunud analüüsi tõenditega.

Arvati, et XRCC1 Arg399Gln polümorfismi seostatakse ka Aasia vähi teiste vähivormidega, mille hulka kuulusid kolorektaalne vähk, 42 kopsuvähk, 43 basaalrakuline kartsinoom 44 ja nii edasi. Wangi jt uurimus . 42 näitasid, et XRCC1 399Gln alleel oli seotud meeste seas suurenenud pärasoolevähiriskiga. Lisaks võib XRCC1 Arg399Gln polümorfism muuta Hiinas mittesuitsetajatel kopsuvähi riski. 43 Kang jt. 44 leidsid, et XRCC1 Arg399Gln polümorfism oli seotud basaalrakulise kartsinoomi suurenenud riskiga. Arvestades XRCC1 geeni olulist rolli, on bioloogiliselt usutav, et XRCC1 polümorfism võib muuta PCa riski. Näidati, et XRCC1 Arg399Gln polümorfism on korrelatsioonis DNA parandamise aktiivsusega ja seostatav vastuvõtlikkusega mitmesuguste vähkide, sealhulgas PCa suhtes. 18, 21 on näidatud, et XRCC1 Gln / Gln genotüübi olemasolu on seotud kasvaja supressorigeeni TP53 mutatsioonidega, õdekromatiidide 45 kõrgendatud tasemega 15 ja DNA aduktide kõrgema tasemega. Seega võib see muuta PCa tundlikkust, eriti Aasia elanikkonnas.

Leidsime, et XRCC1 Arg399Gln polümorfismi variandi genotüüpi Kaukaasia populatsioonis ei seostatud PCa riski olulise suurenemisega. See tulemus oli kooskõlas varasemate uuringutega. 17, 19, 24 Kuigi XRCC1 Arg194Trp polümorfismi võib seostada DNA parandamise aktiivsusega, ei leitud Kaukaasia ja Aasia populatsioonides variandi genotüübi olulist seost PCa riskiga, mis viitab sellele, et geneetilise variandi mõju võib varjata muud PCa-ga seotud seni tuvastamata põhjuslikud geenid. Lisaks võib seda tulemust mõjutada etniliste erinevuste võimalik roll geneetilises taustas ja keskkonnas, kus nad elasid. Oma osa võivad omada ka muud tegurid, näiteks valiku kallutamine, erinevad sobitamiskriteeriumid.

DNA parandusgeen XRCC1 kodeerib DNA polümeraasi β, DNA ligaasi III, inimese AP endonukleaasi, polünukleotiidi kinaasi ja polü (adenosiindifosfaadi riboosi) polümeraasiga füüsiliselt seotud tellingute valke, mis funktsioneerib kompleksis, et hõlbustada aluse ekstsisiooni parandamist ja ühe ahelaga purunemisprotsessid. Aluse ekstsisiooniparandustee eemaldab peamiselt mittemahukad alusadduktid, mis on tekkinud metüleerimise, oksüdeerimise või ioniseeriva kiirguse või oksüdatiivse kahjustuse toimel redutseerimise teel. Mitmed uuringud 46, 47, 48 osutasid võimalikule koostoimele XRCC1 polümorfismide ja keskkonnategurite vahel vähiriski osas. Geenide ja keskkonna interaktsioonid on pakkunud suurt huvi geneetiliste polümorfismide täpse rolli hindamiseks. Nende uuringute algupäraste andmete puudumine piiras aga meie edasist hinnangut võimaliku geeni-keskkonna koostoime kohta.

Selle meta-analüüsi mõningate piirangutega tuleks tegeleda. Esiteks piiras esialgsete andmete puudumine võimalike koostoimete edasist hindamist, kuna geeni-geeni, geenikeskkonna ja isegi sama geeni erinevate polümorfsete lookuste vastastikmõjud võivad moduleerida PCa riski. Teiseks põhines meie tulemus korrigeerimata hinnangutel, kuigi täpsema analüüsi korral tuleks läbi viia täpsem analüüs, mis võimaldaks muude tegurite, nagu vanus, suitsetamine ja alkohol, kohandatud hinnangut. Andmete analüüsimiseks vajaliku teabe puudumine võib põhjustada tõsiseid eksitavaid eelarvamusi. Kolmandaks, selles metaanalüüsis polnud Aafrika rahvastiku kohta piisavalt andmeid, eriti Arg194Trp polümorfismi kohta.

Kokkuvõtlikult andis see metaanalüüs tõendusmaterjali XRCC1 Arg399Gln ja Arg194Trp polümorfismide ja PCa riski vahelise seose kohta, kinnitades hüpoteesi, et nii Arg399Gln kui ka Arg194Trp polümorfismid ei olnud seotud üldise PCa riskiga. Alarühma analüüsis leiti XRCC1 399Gln alleeli olulist seost PCa riskiga ainult Aasia meestel. Tulevases analüüsis tuleks siiski arvestada ka keerukamate geeni- geeni- ja geenikeskkonna interaktsioonidega, mis peaks aitama paremini mõista XRCC1 polümorfismide ja PCa riski seost.

Täiendav teave

Wordi dokumendid

  1. 1

    1. lisa tabel

  2. 2

    2. tabel

    Täiendav teave on lisatud eesnäärmevähi ja eesnäärmehaiguste veebisaidil (//www.nature.com/pcan)