Vaatab üle geneetika (Aprill 2020)

MikroRNA-d Hoxi võrgus: ilmne seos tagumise levimusega

MikroRNA-d Hoxi võrgus: ilmne seos tagumise levimusega

Abstraktne Homeoboxi (Hox) transkriptsioonifaktorid annavad selgroogsete embrüotele telje koordinaadid ees-taga (AP). Hoxi geene leidub klastrites, mis sisaldavad ka mikroRNA (miRNA) geene. Meie prognoositud miRNA sihtmärkide analüüs näitab, et Hoxi klastrisse manustatud miRNA-d sihivad eelistatavalt Hoxi mRNA-sid. Lis

Põgusalt

Põgusalt

Geneetilised ekraanid Genoomi hõlmav transgeense RNAi raamatukogu tingimuslikuks geeni inaktiveerimiseks Drosophilas . Dietzl, G. jt . Loodus 12. juuli 2007 (doi: 10.1038 / nature05954) See artikkel kirjeldab suuremahulise transgeense raamatukogu loomist ja valideerimist RNAi skriinimiseks Drosophila melanogasteris , mis võimaldab geenifunktsioone analüüsida kõigis kudedes ja arenguetappides. Tra

Tõuaretus ja epigeneetika: nii kahjulikud kui ka kahjulikud mõjud

Tõuaretus ja epigeneetika: nii kahjulikud kui ka kahjulikud mõjud

Õppeained Epigeneetika Tõuaretus Christian Biémonti kirjavahetusartikkel (Biémont, C. Inbreeding effects in epigenetic age. Nature Rev. Genet. 11 , 234 (2010) 1 ja artiklid (Charlesworth, D. & Willis, JH Inbreeding depressiooni geneetika. Nature Rev Genet. 10 , 783–796 (2009) 2, 3, mida ta arutab, vääriksid edasist dialoogi. Nendes

Geneetilise privaatsuse rikkumise ja kaitsmise viisid

Geneetilise privaatsuse rikkumise ja kaitsmise viisid

Õppeained Andmete avaldamine ja arhiveerimine DNA järjestamine Eetika Geneetilised andmebaasid Algne artikkel avaldati 8. mail 2014 Loodusarvustused Genetics 15 , 409–421 (2014) Ülaltoodud artiklis oli viites 107 esitatud vale tsitaat. Tsitaat pidanuks olema: Ayday, E., Raisaro, JL, McLaren, PJ, Fellay, J. &am

Päritavad panused versus geneetiline arhitektuur

Päritavad panused versus geneetiline arhitektuur

Õppeained Haiguste geneetika Epidemioloogia Geneetiline variatsioon Geenivaramu assotsiatsiooniuuringud Pärilik kvantitatiivne omadus Meditsiiniline genoomika Järgmise põlvkonna järjestamine Lugesime huviga Evansi ja Kelleri kirjavahetust (Jaotatud pärilikkuse meetodite kasutamine geneetilise arhitektuuri uurimiseks. Nat.

Mutatsioonimäära varieerumine eukarüootides: kohaspetsiifiliste mehhanismide evolutsiooniline mõju

Mutatsioonimäära varieerumine eukarüootides: kohaspetsiifiliste mehhanismide evolutsiooniline mõju

Baer jt ülevaade “Mutatsioonikiiruse varieerumine mitmerakulistes eukarüootides: põhjused ja tagajärjed” 1 näitab täpselt enamiku kirjanduse põhijooni mutatsioonikiiruse arengu kohta. Isegi tunnistades, et mutatsioonide määr võib genoomis erinevates kohtades dramaatiliselt erineda, eirab see kirjandus või minimeerib kohaspetsiifiliste mutatsioonimehhanismide eriomadusi ja tagajärgi. Seetõttu soovi

Geneetiliste variantide agregeeritud andmete jagamisel riski hindamine ja juhtimine

Geneetiliste variantide agregeeritud andmete jagamisel riski hindamine ja juhtimine

Õppeained Geneetilised andmebaasid Geneetiline variatsioon Geenivaramu assotsiatsiooniuuringud Algne artikkel avaldati 16. septembril 2011 Loodusarvamused Genetics 12 , 730–736 (2011) Ülaltoodud artiklis oli GWAS Centrali jaoks toodud vale link. Õige link oleks pidanud olema //www.gwascentral.org. Lis

Pilvandmetöötlus genoomiliste andmete analüüsiks ja koostööks

Pilvandmetöötlus genoomiliste andmete analüüsiks ja koostööks

Õppeained Arvutusbioloogia ja bioinformaatika Geneetilised andmebaasid Genoomika Järgmise põlvkonna järjestamine Uurimisandmed Algne artikkel ilmus 30. jaanuaril 2018 Loodusülevaated Geneetika doi: 10.1038 / nrg.2017.113 (2018) Ülaltoodud artikkel väitis algselt: „FireCloud ja CGC tuginevad arvutite ja andmete salvestamiseks AWS-ile ja Google Cloud Platformile. Lisaks

LCN DNA: kas see on mõistliku kahtluseta tõend? - vastus

LCN DNA: kas see on mõistliku kahtluseta tõend? - vastus

McCartney artiklis (LCN DNA: ilma mõistliku kahtluseta tõestus? Nature Rev. Genet. 9 , 325 (2008)) 1 väidetakse, et Omaghi uuring näitas DNA tõendusmaterjali tõsiseid vigu. Kuid suurt osa tõenditest ei olnud meedias teatatud ning seda ei kajastatud ka kohtuotsuses. Teadlase ülesanne on nõuda kohut tõendite tähenduse osas ebasoovitavalt. Järelikul

Inimese kohtuekspertiisi parendamine geneetika, genoomika ja molekulaarbioloogia edusammude kaudu

Inimese kohtuekspertiisi parendamine geneetika, genoomika ja molekulaarbioloogia edusammude kaudu

Õppeained Bioinformaatika Vähi genoomika Eetika Geneetilised tehnikad Genoomika Molekulaarbioloogia Sotsiaalteadused Tehnoloogia Algne artikkel avaldati 18. veebruaril 2011 Loodusülevaated Genetics 12 , 179–192 (2011) Selle artikli joonisel 3 oli kolmanda veeru teist, kolmandat ja neljandat silma ümbritsev punane kast valesti paigutatud. Kast

Kompositsioonilise epistaasi empiirilised testid

Kompositsioonilise epistaasi empiirilised testid

Õppeained Geneetiline interaktsioon Geneetiline variatsioon Statistilised meetodid Cordell on oma ülevaateartiklis (inimese haiguste aluseks olevate geenide ja geenide vastastikmõjude tuvastamine. Nature Rev. Genet. 10 , 392–404 (2009)) 1 ja mujal 2 väitnud Cordell, et koostoimete statistiliste testide kasutamine epistaasi selgitamiseks on piiratud. term

Spetsifikatsiooniprotsesside käsitlemine keerukate tunnustena

Spetsifikatsiooniprotsesside käsitlemine keerukate tunnustena

Oma ülevaate 1 lahtris 4 loetlesid Noor ja Feder kümme näidet geenidest, mis on seotud paljunemisbarjääri moodustamisega, mis võib põhjustada spetsiifilisi sündmusi. Autorid kirjutasid: „... võime olla tulevikus üllatunud, kuna kaardistatakse rohkem tõkkeid ja need tõestavad, et hõlmavad selliseid mehhanisme nagu meiootiline ajam või genoomiline konflikt suuremal määral, kui praegu hinnatakse“ (lk 858). Üks argument, mis

Haruldaste variantide seostamiskatsed: juhtumikontrolli mutatsiooni sõeluuring

Haruldaste variantide seostamiskatsed: juhtumikontrolli mutatsiooni sõeluuring

Õppeained Vähi geneetika Geneetiline testimine Geenivaramu assotsiatsiooniuuringud Haruldased variandid Kaks hiljutist ülevaadet, üks ajakirjas Nature Reviews Genetics , autorid Bansal jt . (Haruldaste variantidega seotud assotsiatsiooniuuringute statistilise analüüsi strateegiad. Nature Rev. Genet. 11 ,

Vastus: haplotüübil põhineva genotüübi-fenotüübi analüüsi väärtuse ning andmete teisendamise kohta farmakogeneetikas ja genoomikas

Vastus: haplotüübil põhineva genotüübi-fenotüübi analüüsi väärtuse ning andmete teisendamise kohta farmakogeneetikas ja genoomikas

Tervitan Vormfelde ja Brockmölleri märkusi, mis minu arvates ei ole minuga täielikult vastuolus, vaid lähevad kaugemale, kui mul oli sissejuhatavas artiklis ruumi teha. Siiski tahaksin nende tähelepanekute osas esitada mitu hoiatuslahendust. Haplotüübi analüüsid võivad sageli anda eeliseid ühe SNiP korraga analüüsimise ees, eriti kui, nagu ma märkasin oma ülevaate 1 lehel 787, on cis-s mitu tihedalt seotud funktsionaalset varianti. Seda potentsi