Keemiline bioloogia (Märts 2020)

Hüpoksiast indutseeritava faktori 2 allosteeriline pärssimine väikeste molekulidega

Hüpoksiast indutseeritava faktori 2 allosteeriline pärssimine väikeste molekulidega

Õppeained Biokeemia Biofüüsika Vähk Keemilised tööriistad Suure läbilaskevõimega sõelumine Väikesed molekulid Abstraktne Hüpoksiast indutseeritavad tegurid (HIF) on heterodimeersed transkriptsioonifaktorid, mis on indutseeritud paljude vähktõbede korral, kus need soodustavad sageli protumorigeensete radade ekspressiooni. Ehkki trans

Kiraalne tsüklilisus

Kiraalne tsüklilisus

Õppeained Reaktsioonimehhanismid Keemiline süntees Angew. Chem. Int. Toim. 51 , 1248–1251 (2012) Doominoreaktsioonid pakuvad hõlpsat juurdepääsu keerukatele molekulaarsetele arhitektuuridele, sageli koos suurepärase stereokeemilise juhtimisega. Shi jt . esitage selle lähenemisviisi elegantne näide uues [2 + 2 + 2] tsükloadimisreaktsioonis, mis ühendab Michaeli ja Henry reaktsioone, et pääseda tsükloheksaanproduktile stereokeemiliselt määratletud asendajatega iga tsükli süsiniku juures. Eelkõige kasutasi

Inteinid mähiste all

Inteinid mähiste all

Õppeained DNA kahjustus ja parandamine Ensüümi mehhanismid Tõlkejärgsed modifikatsioonid Valgu struktuuri ennustused Nukleiinhapped Res. doi: 10.1093 / nar / gkv612 Inteiinid on isesõltuvad elemendid, mis eraldavad end transleeritud valkudest, et jätta maha ekstein ehk küps valk. Arvatakse, et suurem osa funktsionaalselt olulistest jääkidest on inteini sisesed, kuigi on näidatud, et mõned inteiniini vahetult piirneva eksteini järjestuse mõned jäägid mõjutavad funktsiooni. Teatakse, et mõ

Minimaalne teave biosünteetilise geeniklastri kohta

Minimaalne teave biosünteetilise geeniklastri kohta

Õppeained Biosüntees Looduslikud tooted Järjestuse märkus Sünteetiline bioloogia Biosünteetilistesse geeniklastritesse on teadaolevalt mitmesuguseid ensümaatilisi radu, mis tekitavad bakterites, seentes ja taimedes spetsiaalseid metaboliite. Teave nende klastrite, liikumisviiside ja metaboliitide kohta on praegu kogu kirjanduses hajutatud, muutes selle kasutamise keeruliseks. Biosü

Peptiidide mobiliseerimine immuunsuses

Peptiidide mobiliseerimine immuunsuses

Õppeained Immunoloogia Peptiidid Immuunsüsteemi rakendamist haiguste raviks aitab paremini mõista peptiidide päritolu ja rolli immuunsuses. Juba üle 30 aasta on teada, et peptiidid on immuunsussüsteemi mobiliseerimisel kriitilised tegurid võõraste sissetungijate vastu. Sellest ajast alates on uued teadmised peptiidide genereerimise ja funktsiooni kohta immunoloogias toetanud immuunsussüsteemi haiguste raviks rakendamist. Enamik

Erratum: aminoglükosiidi aktiivsus, mida täheldatakse üksikutel translokatsioonieelsetel ribosoomi kompleksidel

Erratum: aminoglükosiidi aktiivsus, mida täheldatakse üksikutel translokatsioonieelsetel ribosoomi kompleksidel

Õppeained Toimemehhanism Ribosoom Struktuuribioloogia tRNA-d Algne artikkel avaldati 29. novembril 2009 Nat. Chem. Biol. 6 , 54–62 (2010); avaldatud veebis 29. novembril 2009; parandatud pärast printimist 12. veebruaril 2010 Selle artikli algselt avaldatud versiooni joonisel 6a toodud võtmes olid kahe inhibiitori kontsentratsiooni ühikud valesti tähistatud kui “M”, kus nad oleks pidanud lugema “μM”. Viga on parand

Erratum: ülevaade mukopolüsahharoosist I α-L -iduronidaasi struktuurist ja toimimisest

Erratum: ülevaade mukopolüsahharoosist I α-L -iduronidaasi struktuurist ja toimimisest

Õppeained Keemiline bioloogia Ainevahetushäired Struktuuribioloogia Algne artikkel ilmus 11. septembril 2013 Nat. Chem. Biol. ; doi: 10.1038 / nchembio.1357; parandatud veebis 20. septembril 2013 Selle artikli veebis algselt avaldatud versioonis, meetodite jaotises “Sünteesitud IDUA inhibiitorid”, anti 5F-IdoAF-i jaoks kaks erinevat keemilist nimetust ja 2F-IdoAF-i täielik nimi jäeti tahtmatult ära. Lisaks k

Parandus: raku signaliseerimiseks toodetud vesinikperoksiidi molekulaarne pildistamine

Parandus: raku signaliseerimiseks toodetud vesinikperoksiidi molekulaarne pildistamine

Algne artikkel avaldati 01. aprillil 2007 Nature Chemical Biology 3 , 263–267 (2007); avaldatud veebis 1. aprillil 2007; parandatud pärast printimist 3. mail 2007 Selle artikli algselt avaldatud versioonis on teise autori perekonnanimi valesti kirjutatud. Autori nimi peaks olema Orapim Tulyathan. Viga on parandatud artikli HTML- ja PDF-versioonides. A

Parandus: raku eluea väikestel molekulidel põhinev pöörduv ümberprogrammeerimine

Parandus: raku eluea väikestel molekulidel põhinev pöörduv ümberprogrammeerimine

Nature Chemical Biology 2 , 369–374 (2006); avaldatud veebis 11. juunil 2006; parandatud pärast printimist 22. detsembril 2006 Selle artikli algselt avaldatud versioonis ei kuulutatud ühtegi konkureerivat majanduslikku huvi. Autorid kinnitavad nüüd, et neil on konkureerivaid huvisid, mis võiksid mõjutada käesolevas artiklis kajastatud tulemusi ja arutelu, mida on üksikasjalikult käsitletud artiklile lisatud konkureerivate finantshuvide deklaratsioonis. Viga on p

Parandus: SMN2 splaissimodulaatorid suurendavad U1-pre-mRNA seost ja päästavad SMA hiired

Parandus: SMN2 splaissimodulaatorid suurendavad U1-pre-mRNA seost ja päästavad SMA hiired

Algne artikkel avaldati 01. juunil 2015 Nat. Chem. Biol. 11 , 511–517 (2015); avaldatud veebis 1. juunil 2015; parandatud veebis 15. juulil 2015 Autorid unustasid lisada võrgumeetodites SMN-valkude taseme mõõtmise kirjelduse koeproovides. See kirjeldus on lisatud artikli HTML- ja PDF-versioonidesse. Aut

Koostöö jäädvustamine

Koostöö jäädvustamine

Koostöökäitumise ühiste määratluste ja mehhanismide arvestamine võib anda uusi teadmisi keemilisest ja bioloogilisest funktsioonist. Koostöö on hästi tuntud kui mitmesuguste mikroskoopiliste sündmuste, näiteks metalliioonide samaaegse kelaadi moodustumise, valkude voltumise ajalise koordinatsiooni ja biomolekulaarsete sõlmede kooskõlastatud funktsiooni energeetiline alus. Makroskaala

Ääretu RNA jaoks

Ääretu RNA jaoks

Kaks 2006. aasta Nobeli preemiat kajastavad RNA keskset rolli geeniregulatsioonis ja rõhutavad avastuste koosmõju keemias ja bioloogias. RNA on esinenud silmapaistvalt hiljutiste murranguliste avastuste seerias. 2006. aasta detsembris tunnustas Nobeli komitee kahte sellist edusammu, määrates Roger Kornbergile Nobeli keemiapreemia töö eest RNA transkriptsiooni molekulaarsete mehhanismide väljaselgitamisel ning Craig Mellole ja Andrew Fire'ile nende avastuse eest Nobeli füsioloogia või meditsiini preemia. RNA int

Parandus: dünaamika ühendab substraadi äratundmise proteiinkinaas A katalüüsiga

Parandus: dünaamika ühendab substraadi äratundmise proteiinkinaas A katalüüsiga

Õppeained Ensüümi mehhanismid Kinaasid Molekulaarne konformatsioon Algne artikkel avaldati 03. oktoobril 2010 Nat. Chem. Biol. 6 , 821–828 (2010); avaldatud veebis 3. oktoobril 2010; parandatud pärast printimist 18. aprillil 2011 Selle artikli algselt avaldatud versioonis tunnistasid autorid valesti, et rahastasid USA riiklikud tervishoiuinstituudid GM64742. Õige

Veenvad märkused

Veenvad märkused

Õppeained Keemiline bioloogia Kirjastamine Teadlased peavad olema tähelepanelikud, et tagada avaldatud dokumentide terviklikkus ja leida uusi viise, kuidas hõlbustada teaduslikku arutelu elektroonilisel ajastul. Meie ajakohaste reportaažide ja sotsiaalsete võrgustike loomise ajastul jõuavad värskelt avaldatud teaduslikud avastused - eriti need, mis ilmuvad kõrgetasemelistes ajakirjades - suurema teadlaskonna ja laiema üldsuseni suurema tõhususega. Kuid nei

Erratum: Endoplasmaatiline retikulum Ca2 + suurendab mutantse glükotserebrosidaasi proteostaasi

Erratum: Endoplasmaatiline retikulum Ca2 + suurendab mutantse glükotserebrosidaasi proteostaasi

Õppeained Kaltsiumi signaalimine Endoplasmaatiline retikulum Ainevahetushaigused Algne artikkel avaldati 9. mail 2010 Nat. Chem. Biol. 6 , 424–432 (2010); avaldatud veebis 9. mail 2010; parandatud pärast printimist 21. mail 2010. Selle artikli algselt avaldatud versioonis anti ühele kasutatud rakuliinidele ekslikult mutandi tähis L444P, viidates joonisele 6a, ja teine ​​rakuliin seda tähist ei lisanud, viidates täiendavale joonisele 11 a, b. Põhiteksti

Silmad pärani lahti

Silmad pärani lahti

Valkude eraldiseisvuse ja loomulikus kontekstis toimimise mõistmiseks on vaja ühendada molekulaarsel tasemel tehnikad, mis uurivad valkude struktuuri ja dünaamika koosmõju. Mõisted "üks geen, üks ensüüm" ja "struktuur määrab funktsiooni" on tänapäevase biokeemia põhialused. Lisage selle

Parandus: neurodegeneratiivse haiguse vastu võitlemine keemiliste sondide ja mudelsüsteemidega

Parandus: neurodegeneratiivse haiguse vastu võitlemine keemiliste sondide ja mudelsüsteemidega

Õppeained Bioloogilised mudelid Keemiline bioloogia Neurodegeneratiivsed haigused Ravimid Nat. Chem. Biol. 10 , 911–920 (2014); avaldatud veebis 17. oktoobril 2014; parandatud pärast printimist 11. detsembril 2014 Selle dokumendi algselt avaldatud versioonis oli tabelis 1 PBT2 faasi kanne tahtmatult tähistatud kui "katkestatud". See

Tegelike sihtmärkide kitsendamine

Tegelike sihtmärkide kitsendamine

Õppeained Keemiline geneetika Proteoomika Sihtmärgi tuvastamine Paljud vähiravi kinaasi inhibiitorid on üsna mitteselektiivsed ja nende rakulised toimemehhanismid on puudulikult mõistetavad. Pesastatud keemilise proteoomika ja keemilise geneetika strateegiast selgub, millised kliinilise kinaasi inhibiitori dasatiniibi rakulised sihtmärgid funktsionaalselt seostuvad selle anti-onkogeense aktiivsusega. Regu

Andmete tööle panemine

Andmete tööle panemine

Õppeained Andmebaasid Genoomika Teadusringkonnad Postgenoomilisel ajastul loodud ulatuslike andmekogumite optimaalne kasutamine eeldab selgeid standardeid ja pühendumust avatud suhtlusele. Keemikud ja bioloogid on traditsiooniliselt arenenud teaduses, määratledes konkreetse huvipakkuva süsteemi, formuleerides süsteemi toimimismudelid ja katsetades neid mudeleid suureneva molekulaarse lahutuse tasemel. Uute

Alumine rida

Alumine rida

Valdkonna edendamiseks on oluline tugevdatud rahastamistoetus ja keemiliste bioloogide suurem kaasatus rahastamisprotsessi. Parimatel aegadel seisavad akadeemilised teadlased silmitsi väljakutsetega, kuidas saada rahastamist oma iseseisvate teadusuuringute toetamiseks. Need pole kordades parimad. Hiljutine majanduslangus ja sellega seotud rahastamisagentuuride eelarvete kahanemine on toonud kaasa üleilmse efekti, mida tunnevad kogu maailma teadusuuringute kogukonnad.

Mis on arvustuses?

Mis on arvustuses?

Õppeained Keemiline bioloogia Vastastikused eksperdihinnangud Teaduskohtunikud aktsepteerivad kriitilist rolli vastastikuse eksperdihinnangu protsessis. Mida me ootame looduse keemilise bioloogia ülevaatajatelt? Vastastikune eksperthindamine on esmane mehhanism kõrgete standardite hoidmiseks ning teadusuuringute täielikkuse ja täpsuse tagamiseks. Sam

Enda leidmine

Enda leidmine

Õppeained Kirjastamine Teie teadustöö saavutuste ja huvidele veebis juurdepääsetavuse tagamine laiendab teie teadustöö ulatust. Teaduslik publitseerimine on muutunud teadusliku uurimistöö sünonüümiks, pakkudes mehhanismi avastuste ja hüpoteeside jagamiseks ning tulevaste ettevõtmiste innustamiseks. Teaduskirjan

Errata: aminoatsüül-tRNA süntetaaside pidev suunatud evolutsioon

Errata: aminoatsüül-tRNA süntetaaside pidev suunatud evolutsioon

Algne artikkel ilmus 16. oktoobril 2017 Nat. Chem. Biol. 13 , 1253–1260 (2017); avaldatud veebis 16. oktoobril 2017; parandatud pärast printimist 1. detsembril 2017 Selle artikli algselt avaldatud versioonis viidi joonise 4c võtmes p- NF ja p -IF siltide värvid üle. Tsüaaniribad peaksid vastama p- NF-le ja fuksia ribad p -IF-le. Viga

Parandus: arginiin-ramnosüülimine kui uus strateegia translatsiooni pikenemisfaktori P aktiveerimiseks

Parandus: arginiin-ramnosüülimine kui uus strateegia translatsiooni pikenemisfaktori P aktiveerimiseks

Algne artikkel avaldati 16. veebruaril 2015 Nat. Chem. Biol. ; doi: 10.1038 / nchembio.1751; parandatud veebis 24. veebruaril 2015 Selle artikli algselt veebis avaldatud versioonis jäi teise autori keskmine initsiaal tahtmatult välja. Viga on parandatud selle artikli printimis-, PDF- ja HTML-versioonide osas.

Parandus: Allosteerilised peptiidid seovad kaspaasi zügeeni ja vahendavad kaspaasi tetramerisatsiooni

Parandus: Allosteerilised peptiidid seovad kaspaasi zügeeni ja vahendavad kaspaasi tetramerisatsiooni

Õppeained Narkootikumide sõeluuring Ensüümi mehhanismid Neurodegeneratiivsed haigused Struktuuribioloogia Algne artikkel avaldati 10. juunil 2012 Nat. Chem. Biol. 8 , 655–660 (2012); avaldatud veebis 10. juunil 2012; parandatud pärast printimist 21. mail 2013 Selle artikli algselt avaldatud versioonis tunnustati Irina Krylovat tahtmatult, mitte ei lisatud autorite nimekirja. Autor